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本帖最后由 图书管理员 于 2017-5-3 23:31 编辑
基因检测面面观——EGFR专题
吉因加医学中心黎琴
直播视频,请见1,2,3楼
三、EGFR少见突变与靶向药物
介绍完了常见突变与靶向药物,前面这些都是EGFR里面的 常客。其实EGFR中还有一些“稀客”,也就是少见突变。我们来看一下EGFR的少见突变都有哪些,怎么用靶向药。
在药物使用-耐药-新药研发过程中,又陆续发现EGFR的很多其他突变。截至目前已经发现的EGFR基因突变超过了200个。这200个突变并不是同等概率出现的。
下面这张图是来自于2007年发表在Nature Genetic上的一篇对EGFR基因突变与药物敏感性相关的总结文献。在这里我们可以看到,EGFR基因共有28个外显子,其中18-21外显子位于激酶区,对基因功能有重要作用,EGFR主要的基因突变都分布在这几个外显子上。
而在18-21外显子上的不同突变的药物敏感性是不一样的,下面紫色的突变主要是对一二代药物敏感的突变靶点,而上面黄色突变主要是对一二代药物耐药的突变靶点。
不同突变在肺癌中发生的比例不同,像19外显子缺失、L858R都属于常见突变,占40%或以上;T790M突变在一二代药物耐药突变中占50%;其余突变的发生比率较低,约存在于5%的非小细胞肺癌病人中,称为少见突变。
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多数TKI临床研究要么排除了少见突变,要么就是单纯分为常见突变和少见突变,只针对少见突变的临床随机数据很少。但从各种病例报道、回顾性研究和合并分析中,可看到少见突变的一些共同特征。总体来说,除外20外显子突变以外,18、19和21突变对都TKI敏感,但不同突变对一二三代药物的敏感性都略有不同。
从图中可以看出,一代TKI对除了20插入、T790M不敏感以外,对其他少见突变的客观缓解率都能达到50%以上;二代TKI的客观缓解率都高于一代,但对某些少见突变还缺少研究数据;三代TKI对常见突变点效果与一代相当,但在少见突变中缺少研究数据,主要优势在于对T790M突变的抑制作用。
对于不同的治疗方案,少见突变在治疗反应上表现为:对于使用EGFR-TKI治疗,少见突变的治疗效果略差于常见突变(但没有达到显著差异);但与化疗相比,用EGFR-TKI的整体PFS比化疗要好。
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以G719X为例。回顾LUX-LUNG2、3和6研究,838例病人中100例(12%)为少见突变,其中18例为G719X突变,阿法替尼有效率77.8%,PFS和OS为13.8个月和26.9个月,比化疗的PFS8.2个月要好,但比19缺失的33.3个月要差一些。
这是我们这里的另外一个病友的案例。
对于20外显子上的突变,尽管20外显子突变激活EGFR,但与常见敏感EGFR突变不同,激活EGFR未增加受体与TKI结合力。但注意的是,其中A763_Y764insFQEA对TKI有效。
总结
总结一下少见突变,1)存在于约5%的非小细胞肺癌病人;2)18、19、21外显子上的少见突变大多对TKI敏感,20外显子大多对TKI耐药;3)与常见突变患者相比,少见突变使用TKI的治疗效果略差;但与化疗相比要好。
因此在有条件的情况下,对EGFR的常见突变和少见突变都进行检查,可以为部分少见突变患者找到使用靶向药的机会,也可以提示部分原发耐药的患者避免使用TKI。
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四、EGFR-TKI的Rechallenge
前面,我们把EGFR基因突变的情况基本介绍完了。那么,对于靶向药物这一块,我们也都知道,靶向药物使用一段时间之后不可避免地出现耐药,而耐药之后有些情况已经有靶向药物了,但还有很多耐药没有太好的办法,还没有出现一个终极的大boss,可以一劳永逸。免疫治疗可能是一个方向,但现在还在寻找有效的分子标记物。目前很多情况下大家会考虑的一种方式是轮换,那么EGFR-TKI是否也可以在一定条件下再次使用呢?我们称为Rechallenge一下。有哪些成功案例或统计数据可以参考呢?
下面以一个在吉因加做过检测的病友为例进行分析。在2015年底他有EGFR21外显子突变,用1代药物7-8月,进展之后就开始改用化疗药物。换了几个方案,但是效果不是太好。他到2016年底就来做基因检测,看看是否有机会重新使用靶向药物。基因检测结果为,他有两个基因突变,TP53和EGFR,其中的L858R又出现了。这结果是在提示他可以再用回EGFR-TKI。那么为什么会出现这种情况呢?
为了探究这个现象,我们检索出了4篇文献。他们都是既往TKI有效的NSCLC中EGFR-TKI Rechallenge的情况。因条件限制,仅第二的案例是在用回EGFR-TKI之前进行了基因检测,其他3都是没有进行基因检测就直接用了这个药物的。我们可以看出这之中对疾病的空置率还是比较高的,从40%多到80%多。那么是不是所有病人都再次出现了EGFR突变呢?
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下面我们对T790M消失后EGFR-TKI Rechallenge的5个案例进行研究。
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下图中(-)阴性,+为阳性,箭头加字母表示他用的治疗方案是什么。我们可以看出这位24号病人,一开始他有L858突变,但是T790M是阴性的,所以他用了1代的易瑞沙。用了一段时间后T790M出现了。紧接着,他就换用了其他治疗方案,一般是化疗。一段时间后,T790M消失了,变成了阴性,他就又用回了TKI。但是同样的,T790M这个突变会再次出现。这就是通过基因检测判断他的突变是否出现,来调整他的治疗方式。最后他的PPs达到了48个月以上。总的看来是非常不错的。
其实T790M的出现是和TKI的刺激是有关系的,当你刺激它一段时间他就出现,当你换用别的治疗方式,他有可能消失。这时,就给予了一个机会,再用回TKI。
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我们多久做一次基因检测来判断T790M是否消失呢?太密集不现实。参照上面的文献,我们可以看出6-12个月做一次基因检测可以辅助判断。
五、总结
最后我们来回顾一下今天讲的内容,EGFR作为肺癌靶向治疗中最重要的1个基因,已经被发现有200多个突变。19缺失和L858R突变是最常见的2种突变。一代TKI可有效抑制EGFR敏感突变;二代TKI是多靶点非选择性不可逆抑制剂,需关注毒副作用;三代TKI是针对T790M这个最常见的继发耐药原因设计的。EGFR除了常见突变以外,还有约5%的非小细胞肺癌患者存在EGFR少见突变。少见突变中18、19、21外显子上的突变大多仍对TKI敏感,而20外显子的突变大多对TKI耐药。
靶向药物要在有靶点的病人身上使用,才能发挥最好的疗效。没有靶点的病人使用靶向药的有效率非常低。因此,全面、准确地了解基因突变情况,才能知己知彼,在与癌共舞的路上发挥好每一个靶向药物的作用 。
问题回答
Q:基因检测需要什么样本,必须使用血液吗,蜡片是否可以?
A:
每一个病人的血液和蜡片是不一样的,我们要具体问题具体分析。对于初诊病人,他有穿刺和手术的切片在,对于局部淋巴结转移的病友来说,游离片段释放到DNA里面的浓度可能比较低,也有可能局部病灶它不释放到血液里面去,这时候用组织切片往往比血液更好。对于其他情况,比如远处大器官转移的,例如肝,肺。由于组织会有异质性,大器官里面的能力比较强,这时候血液就是比较好的选择。如果是多次的重复采样,对于组织来说,不是太方便,可能会造成损伤,这样血液是更被推荐的。
对于有一些有一些部位的转移,血液可能会有一些局限性,例如脑转移。我们知道,人体里是存在血脑屏障的。脑部里面的东西是很难释放到外周血里面来的。所以使用血液转移可能不能反映脑部基因突变的情况。在某些情况下,医院会选择抽取脑脊液。另一种是有胸腹水的情况。某些病人他有胸水,但没有大器官的转移。根据我们吉因加的数据来看,胸水也是一种可以考虑的样本方式。胸水上清里面也存在肿瘤片段。它和肿瘤细胞不一样,它也是由肿瘤细胞释放出来的。尤其是肺癌,在胸水里,游离的肿瘤细胞片段可能比外周血里面更富集,检出率更好一些。因此选用什么样本类型,是根据每个病人的病情和病灶来选择的。
Q:外周血基因检测准确吗?
A:
这个问题一方面和上一问题有关联,另一方面是与技术有一些相关性。外周血检测的下限是千分之一,也就是说基因突变频率在千分之一以上的我们可以查出来,千分之一以下的在技术范围以外。这就像捕鱼,鱼比千分之一大,它可以被我们能捞到,比千分之一小,它就从网眼里跑出去了。
同时,外周血检测,它还会受一些病灶部位的影响。比如刚才提到的脑转移的情况,我们就查不出来了。还有一些特殊部位也难以查到。一般,一些血流比较丰富的部位,外周血的检测效果还是不错的。
Q:检测出的突变丰度与靶向药即将发挥多大作用相关?
A:
我对这个病友问题的理解是,基因突变的丰度要有多大的比例以上,才对用靶向药物有意义。是越高越好?还是说低于一定的值以后,用靶向药的效果就不好了?
对这个问题,我觉得要分两个方面来看。一个是对组织来说的话。如果检测的是一块组织,组织是有异质性的,如果检测出有基因突变,那么肿瘤中是有突变存在,有靶点存在。但是如果基因突变率很低甚至是没有的话,因为我们取的是肿瘤中很小的一部分,所以不能确定其他部位有没有基因突变。所以一般情况下,只要是有基因突变,我们用靶向药都是有效的。而对于另一部分,血液来说的话,根据我们了解的既往的文献报道的情况来看,由于每个个体的CT DNA的影响因素非常多,所以它们的差异都特别大,那么突变丰度多高是因人而异的。我们看到文献中有一些患者,他血里的突变达到千分之四,他对靶向药物依然非常的敏感,而另一些病友,他的突变频率达到百分之几,但是他对靶向药物的敏感性就很差。因此,这是个人有差异的。对于突变丰度的比例来说,我们认为人和人之间的比较是比较难的,但是自己和自己比较是可以的。例如,你之前的突变频率是百分之一,用这个药物有效,过一段时间检测到这个比例变低了,说明有这个靶点的细胞被清除掉了,可能再过一段时间这个比例又升上去了,那么这个时候对这个靶向药物依然是敏感的。
Q:盲试易瑞沙1年有效后耐药,最初的颈部病理切片还能用来基因检测么?
A:
我觉得这需要结合这位病友目前的病灶情况来考虑。如果继续使用1年前的病理切片,因为已经经过了1年的靶向药治疗了,那么这个基因很大可能会发生一定程度上的改变,就可能有两种情况。一种情况是,他的敏感靶点,经过1年药物治疗消失了,第二种情况是,经过1年TKI的刺激,它出现了继发耐药的情况,说明它的继发耐药基因产生了,这时再用1年前的病理切片,就可能反映不出现在的情况了。
遇到这种情况我们还是建议用现在的样本来做,比如活检,穿刺样本,外周血,这样更能体现病友现在的基因突变情况。
Q:告诉我20突变是什么鬼?
A:
20号基因突变,它也位于18-21这个区段以内,它的突变也会导致EGFR的激活,但是激活方式不一样。1,2,3代TKI都是通过结合ATP,结合位点来起到抑制的效果的,但是20号基因突变的方向是不一样的,所以1,2,3代TKI对它不能起效果。目前还没针对20号突变的靶向药物,当然,有可能是它发生的几率低一些。
Q:非北京的异地的患者如要检查如何处理?
A:
目前的物流都是很方便的,无论是组织还是外周血,用专业的采血管,切片就更简单,打包好,联系专业物流,寄送到检测公司就可以。
Q:21突变,易瑞沙三个月耐药,特罗凯三个月耐药,2992三个月开始CEA略涨,第四个月准备加量到70,下一步用药怎么办,联药还是9291?
A:
这位病友,开始有21突变,但是用易瑞沙,特罗凯三个月就耐药了,这在临床上叫快速进展。这可能是存在原发耐药的情况。所以,要看目前病友有没有病灶的转移。如果有,那就推测有很大可能,存在C-MET扩增存在。另外,还有一种概率小的可能,就是存在原发的T790N突变。推荐基因检测后再做判断。这可能有三种情况。一,存在C-MET扩增存在,用对应的靶向药物;二,存在T790N突变,用9291;三,他有其他的信号通路被激活,那就要根据信号通路使用药物了。可能还存在一种情况,就是存在21号,没有找到明确耐药原因,或者连21号耐药基因都找不到了,什么都没有找到,这也是有可能的这种情况推荐化疗。推荐这位病友先做基因检测,再做判断。
Q:9291耐药后怎么处理?
A:
9291耐药有很多原因,比如C797S顺势的情况,目前没有太好的靶向药物,建议先化疗,再观察,是否对TKI复敏。第二种情况就是旁路激活,C-MET,……
这需要先确定是什么信号通路被激活,再治疗。第三种就是,靶点不存在了,无论是之前敏感的还是后面耐药的,都不见了,如果病情进展的话,建议考虑回到化疗。建议在病情进展的情况下,做基因检测来明确问题。
吉因加
与癌共舞
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